Theo Quyếtđịnh số 392/QĐ-BVHTT, ngày 20 tháng 2 năm 2006 của Bộ trưởng Bộ Văn hoá Thông tin về việc cho phép Sở Văn hoá- Thông tin Hà Tây phối hợp với Bảo tàng Lịch sử Việt Nam khai quật khảo cổ học khu vực Tam Bảo, thuộc di tích chùa Đậu, xã Nguyễn Trãi, huyện Thường Tín, tỉnh Hà Tây. Mục đích phục vụ dự án trùng tu tôn tạo chùa Đậu, một di tích lịch sử văn hoá Quốc gia nổi tiếng với hai pho tượng táng Vũ Khắc Minh và Vũ Khắc Trường
Theo Quyếtđịnh số 392/QĐ-BVHTT, ngày 20 tháng 2 năm 2006 của Bộ trưởng Bộ Văn hoá Thông tin về việc cho phép Sở Văn hoá- Thông tin Hà Tây phối hợp với Bảo tàng Lịch sử Việt Nam khai quật khảo cổ học khu vực Tam Bảo, thuộc di tích chùa Đậu, xã Nguyễn Trãi, huyện Thường Tín, tỉnh Hà Tây. Mục đích phục vụ dự án trùng tu tôn tạo chùa Đậu, một di tích lịch sử văn hoá Quốc gia nổi tiếng với hai pho tượng táng Vũ Khắc Minh và Vũ Khắc Trường
Cuộc khai quật được tiến hành vào cuối tháng 2/2006, trên diện tích là 386,5m2. Sau một thời gian tiến hành, kết quả thu được bước đầu rất khả quan. Tại hố khai quật đã xuất lộ mặt bằng toà Tam Bảo thời nhà Mạc; Hệ thống thoát nước thời nhà Trần cùng một số di vật. Dự báo đây là địa điểm khai quật khá thú vị, kết quả thu được sẽ là nguồn tư liệu quan trọng giúp cho công tác trùng tu, tôn tạo ngôi chùa rất nổi tiếng này. Cuộc khai quật dự tính sẽ kết thúc vào cuối tháng 5/2006.